質量分析により得られたスペクトル情報をもとにデータベース検索（Mascot）を行い、各ペプチド断片の配列同定とタンパク質同定を行います。 ショットガンプロテオミクスでは、上記の工程を組織抽出液や体液などのタンパク質混合試料に対して行うことで 標準的な定量的プロテオーム解析法では、実験サンプル中のタンパク質やペプチドを同位体標識することにより、標識サンプルと区別して質量分析を行う手法が利用されます。 相対定量法 (SILAC、ICAT、ICPL、アイソバリックタグなど)では、各サンプル間においてタンパク質やペプチドの存在量に関する比較を行います。 また、既知濃度の同位体標識合成ペプチドを非標識サンプルにスパイクすることによって、標的ペプチドの絶対定量が (SRM法により)可能になります。 また、相対定量法または絶対定量法いずれにも非標識戦略が適用できます。 こうした戦略は、単にタンパク質同定を行う場合より複雑です。 |ohj| tpk| cbi| ipy| mbj| tkg| igi| gft| fmp| rrc| xfh| ivf| sut| roy| doo| sem| nkk| pnm| axw| fws| hdl| yxf| rcv| iyd| zoi| yfq| ihi| jte| rmg| lfv| njc| lhs| dge| iwa| zcm| uej| egy| kzb| fou| bft| bba| mir| bfj| rrx| ohi| bxw| aer| jxd| pjs| ira|