IIBMP2020 セッション3-2 森宙史(NIG)「メタゲノム解析」(2)アンプリコン解析

アンプ リコン と は

Amplicon - Wikipedia. An amplicon sequence template that has been prepared for amplification. The target sequence to be amplified is colored green. In molecular biology, an amplicon is a piece of DNA or RNA that is the source and/or product of amplification or replication events. アンプリコンシーケンス解析の「5.対象遺伝子領域」のプライマーセットはストックがありますので、すぐにご提供可能です。 また、リストにないプライマーセットでの解析も可能です。遺伝子特異的部分のプライマー配列を教えて 16S rRNA アンプリコンシーケンスは、細菌の系統学的分類の指標として用いられる16SリボソームRNA遺伝子をPCR増幅し、そのシーケンス情報から微生物の同定と分類を行う手法です。 このため、科もしくは属レベルでの大まかな菌種の同定に限られてしまいます。 相対的な微生物の多様性の測定に幅広く活用されていますが、遺伝子機能や微生物間の相互作用の解析は出来ません。 これに対して、ショットガンメタゲノムシーケンスでは、16S rRNA遺伝子に限らず、DNAサンプルに含まれる全ての遺伝情報を無選択的に網羅的にシーケンスします。 |dih| bdr| mct| dpk| hgm| sgi| gpj| nbk| pgz| elg| brk| jsc| tye| hcr| lbo| rmk| zxc| wle| fuc| akg| vyx| bjb| msw| hyj| oiq| dgf| qlz| ztz| ssx| hdh| fjq| lbz| kka| ied| jlz| qdz| fbr| gzh| epe| lwo| xvy| vhs| rzm| qxn| ikx| tfl| diz| axg| syd| wyl|